實時熒光PCR技術(shù)進行核酸檢測過程
核酸檢測是查找患者的呼吸道標本、血液或糞便中是否存在外來入侵的病毒的核酸,來確定是否被新冠病毒感染。因此一旦檢測為核酸“陽性”,即可證明患者體內(nèi)有病毒存在。核酸檢測,從基因水平檢測病毒,具有高度的敏感度和特異度,且克服了病毒分離鑒定耗時長。核酸檢測的物質(zhì)是病毒的核酸??乖瓩z測窗口期的缺點,2019-nCoV屬RNA病毒,需要先逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,再進行擴增檢測,通過熒光定量PCR所得到的樣本Ct值得大小,可以判斷患者樣本中是否含有SARS-CoV-2。
RT-PCR技術(shù)原理:
Real-time quantitative PCR技術(shù)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子產(chǎn)生,通過熒光信號不斷累積而實現(xiàn)實時監(jiān)測PCR全程,然后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。熒光定量PCR儀能夠監(jiān)測出熒光到達預(yù)先設(shè)定的閾值的循環(huán)數(shù)(Ct值)與病毒核酸濃度有關(guān),病毒核酸濃度越高,Ct值越小。
熒光閾值:PCR反應(yīng)的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號,熒光閾值的缺省設(shè)置是3~15個循環(huán)的熒光信號標準偏差的10倍;
Ct值:C代表Cycle,t為threshold,Ct值的含義是每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。
檢測流程:
檢測主要經(jīng)過取樣、留樣、保存、核酸提取、上機檢測等五個步驟:
① 取樣:用咽拭子擦拭咽后壁及雙側(cè)咽扁桃體處各5~10次,且不斷旋轉(zhuǎn)拭子;
② 留樣:將拭子頭浸入細胞保存液中,折斷尾部后立即旋緊管蓋子,進行留樣;
③ 保存:將樣品2~8℃保存,并及時送檢;
④ 核酸提?。簩缁畈《竞蟮臉颖具M行核酸提??;用于后續(xù)檢測;
⑤ RT-PCR核酸檢測:將提取物進行RT-PCR擴增反應(yīng),反應(yīng)時間約為70~80min。
優(yōu)勢:
① 縮短了檢測時間,提高了檢測效率,降低檢測過程中可能出現(xiàn)的污染和假陽性;
② 可通過繪制融解曲線、使用特異性探針等方式降低非特異性擴增,所以相比于常規(guī) RT-PCR,其具有操作簡便快捷,特異度強,靈敏度高等優(yōu)點。