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蛋白質(zhì)印跡法(免疫印跡試驗WB)常見問題解答合集

蛋白質(zhì)印跡法(免疫印跡試驗)即Western Blot,(WB) 它是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實驗方法。基本原理在電場的作用下將電泳分離的多肽從SDS-PAGE凝膠轉(zhuǎn)移至一種固相支持體,然后用這種多肽的特異抗體來檢測。

一、Western blot一般流程:

蛋白樣品的制備:

1、水溶液提取法:稀鹽和緩沖系統(tǒng)的水溶液對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性好、溶解  度大,是提取蛋白質(zhì)最常用的的溶劑,操作相對麻煩,重復(fù)性一般;

2、有機溶劑提取法;

3、離心管柱提取法:超快速,易用,高產(chǎn)及重復(fù)性強;

4通過層析或電洗脫法制備目的蛋白。

二、Western blot常見問題解答

1、我的細胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?

答:有沉淀可能因為你的蛋白沒有變性完全,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時將樣品煮沸時間延長; 也不排除你的抗原濃度過高,這時再加入適量上樣緩沖液即可。

2我做的蛋白質(zhì)分子量很?。?/font>10 KD),請問怎么做WB?

答:可以選擇0.2 μm的膜,同時縮短轉(zhuǎn)移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。

3、最后顯色時用 DAB好還是ECM好?

答:DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制,但被催化時靈敏度差一點,但如果達到閥值,就特別靈敏,可以檢測pg 級蛋白,具體可以根據(jù)你實驗的情況。

4、要驗證某個細胞上有無該蛋白的存在,需要做免疫組化和western blot試驗嗎?做這兩個試驗時的一抗和二抗可以共用嗎?

答:①免疫組化可以用來進行定位,但是不能精確定量,而且有時會有假陽性,不易與背景區(qū)分;Western
 blot可以特異性檢測某個蛋白質(zhì)分子,進行定 量,但是不能定位。
 ②兩種實驗的一抗有時候不能通用,公司的產(chǎn)品說明一般都會說明可以進行什么實驗,在免疫組化時,是否適合石蠟切片或者冰凍切片。

5、細胞水平要做western blot,多少細胞提的蛋白夠做western blot?

答:一般5×106就足夠了。

6、 同一樣品能同時提RNA又提蛋白么?這樣對western blot有無影響?

答:能,沒有問題。

7同一蛋白樣品能同時進行兩種因子的Western Blot檢測嗎?

答:當(dāng)然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品。

8 蛋白變性后可以存放多久?

答:-80℃,一兩年沒有問題。最關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細菌消化掉(也是被酶水解了)。

9、 二抗是生物素化的抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?

答:不能使用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含生物素,用BSA代替應(yīng)該好一點。

10、 做組織樣品的western的時候,怎樣處理樣品?

答:必須進行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,需要注意抑制蛋白酶的活性。

11、免疫組化和Western Blot可以用同一種抗體嗎?

答:免疫組化時抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu)限制,煮后變性會消失。如果你所用的抗體識別的是蛋白上連續(xù)的幾個氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時用于免疫組化和Western,而如果抗體識別構(gòu)象形表位,則只能用于免疫組化。

12、在做Western Blot時,PVDF膜用甲醇浸泡的目的?

答:PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團,使它更容易跟帶負電的蛋白質(zhì)結(jié)合,做小分子的蛋白轉(zhuǎn)移時多加甲醇也是這個目的。

13、檢測同一抗體的磷酸化和非磷酸化的抗原可以在同一張膜上嗎?

答:可以。

14 蛋白質(zhì)的分子量跨度很大,如要分離小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好嗎?

答:這么廣的分布不好轉(zhuǎn)移,一般建議:21kd和66kd可以一起轉(zhuǎn),12%SDS-PAGE,濕轉(zhuǎn)120mA, 45-60min就可以了, 可以根據(jù)你實驗室的經(jīng)驗調(diào)節(jié);170kd 用 7% SDS-PAGE,200mA 90-120min。

15、 細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時有什么原則嗎?受不受組織來源的影響?胞膜和胞漿有區(qū)別嗎?

答:一般來說提取時加入廣譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時保持低溫。若有特殊要求可以選擇相應(yīng)的蛋白酶抑制劑。

16 PVDF膜和硝酸膜結(jié)合蛋白的原理是什么?

答:一般而言,硝酸纖維素膜是通過疏水作用來和蛋白質(zhì)相聯(lián),這樣的話,反復(fù)洗幾次后,蛋白容易掉下來,結(jié)果較差。PVDF膜主要通過它膜上的正電荷和蛋白接合,同時也有疏水作用,但相對較弱。這樣的話,PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,結(jié)果較好。

17、 westernblot內(nèi)參選擇什么合適?

答:這與目標(biāo)抗原的表達位置有關(guān),對于胞漿和全細胞蛋白,可選擇內(nèi)參β-actin、GAPDH和Tubulin;線粒體蛋白則可選擇內(nèi)參VCDA1/Porin和COXIV;核內(nèi)抗原可以選擇內(nèi)參Lamin B1、TBP和histone。

18、不能很好地將大分子量蛋白轉(zhuǎn)移到膜上,轉(zhuǎn)移效率低?

答:轉(zhuǎn)移緩沖液中加入20% 甲醇(終濃度),因為甲醇可降低蛋白質(zhì)洗脫效率,但可增加蛋白質(zhì)和NC膜的結(jié)合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質(zhì)可延長轉(zhuǎn)移時間;轉(zhuǎn)移緩沖液加入終濃度0.1%SDS,也能增加轉(zhuǎn)移效率;使用戊二醛交聯(lián);降低凝膠濃度,如低至6-7%或提高轉(zhuǎn)膜電壓/電流,增加轉(zhuǎn)移時間。

19、轉(zhuǎn)膜時凝膠腫脹或卷曲?

答:可將凝膠在轉(zhuǎn)膜前放到轉(zhuǎn)膜緩沖液中浸泡5-10min。

20、跑膠的條帶歪斜或者漂移?

答:電轉(zhuǎn)儀長期使用導(dǎo)致海綿變薄,“三明治”結(jié)構(gòu)不緊湊導(dǎo)致,可更換或者在兩塊海綿之間墊上少許普通的草紙。

21、轉(zhuǎn)膜后膜上有單個或多個白點?

答:轉(zhuǎn)膜時確保膜和膠塊之間沒有氣泡。

22、轉(zhuǎn)膜緩沖液過熱?

答:緩沖液中離子濃度太低,電流或者電壓過高,轉(zhuǎn)膜過程中注意降溫。

23、顯影后膠片背景太高?

答:轉(zhuǎn)膜前PVDF膜沒有用100%甲醇完全浸濕;洗膜不充分,可以增加膜洗滌次數(shù);封閉不完全,選擇合適的封閉液和提高封閉時間;二抗?jié)舛冗^高,降低二抗?jié)舛?;一抗特異性不強,換用特異性較強的單克隆抗體;曝光時間過長,減少曝光時間。

24、結(jié)果沒有條帶或者條帶很淺,雜交信號很弱?

答:樣品中不含靶蛋白或者含量太低,可增加蛋白上樣量,設(shè)置已知標(biāo)準(zhǔn)量蛋白的對照;抗體稀釋比例太低,孵育時間不夠;轉(zhuǎn)膜不好,轉(zhuǎn)膜后可先用麗春紅染色觀看染色效果;曝光時間過短,增加曝光時間;抗體保存不當(dāng),效價降低。

25、目的條帶位置偏低或者偏高?

答:膠濃度不適合,高分子量要用低濃度膠,小分子蛋白要用高濃度膠。

26、有非特異性條帶?

答:目的蛋白有多個修飾位點(磷酸化位點、糖基化位點、乙酰化位點等),本身可以呈現(xiàn)多條帶;一抗特異性不好,換用特異性較好的單克隆抗體;二抗非特異性引起的結(jié)果,可設(shè)立一組不加一抗只加二抗的平行對照來檢測二抗是否有非特異性結(jié)合;樣品蛋白質(zhì)可能降解,提取蛋白時注意冰上操作,加入適當(dāng)?shù)牡鞍酌敢种苿?,避免樣品反?fù)凍融;抗體濃度過高,降低一抗和二抗的濃度。

27膠片是一片空白,是怎么回事?

答:如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。     二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光;ECM底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置;二抗失活。

28目的條帶是白色,周圍有背景?

答:目的蛋白含量太高;一抗?jié)舛绕?,二抗?/font>HRP催化活力太強。

三、Western blot應(yīng)用:

1、目的蛋白的表達特性分析;

2、目的蛋白與其他蛋白的互作;

3、目的蛋白的組織定位;

4、目的蛋白的表達量分析。

 

 

 

 

 

 

 

 

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