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ssDNA/RNA環(huán)化連接酶
ssDNA/RNA環(huán)化連接酶
商品描述:
商品屬性
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ssDNA/RNA環(huán)化連接酶商品屬性:
產(chǎn)品名稱
規(guī)格
貨號
ssDNA/RNA環(huán)化連接酶
2000U
BJ-PJ6645
ssDNA/RNA環(huán)化連接酶
20KU
BJ-PJ6645
商品介紹:描述: ssDNA/RNA CircLigase 為熱穩(wěn)定的 DNA/RNA 連接 酶,不依賴于 ATP,可催化單鏈 DNA 或單鏈 RNA 的分子內(nèi) 環(huán)化。環(huán)化反應(yīng)中,要求催化底物單鏈 DNA/RNA 具有 5’- 磷酸基團和 3’-OH 基團。對于大于 15nt 的單鏈底物,該酶 都能高效的連接。
組分
活性定義:65°C 1h 條件下,催化 1pmol 5’-磷酸化的 ssDNA
底物環(huán)化,所需的酶量定義為 1Unit。
儲存:-20℃可保存 3 年。
反應(yīng)實例
1. 按以下組分配制反應(yīng)液
CircLigase (100 U/μl) 1 μl
5’磷酸化 ssDNA/RNA 10-100 pmol
10×CircLigase Buffer 2 μl
50mM MnCl2 1 μl
ddH2O Up to 20 ul
65°C 孵育 1h 進行環(huán)化反應(yīng)。
2. 失活反應(yīng)
反應(yīng)結(jié)束后,可加入終濃度 10mM EDTA 終止反應(yīng)?;虿捎?br style="box-sizing: border-box;" /> 加熱方式 85℃ 10min 加熱失活。
使用注意事項:
(1) 環(huán)化底物 ssDNA 或 RNA 必須帶有 5’磷酸基團,3’端含有 OH。
(2) 環(huán)化體系中的 ATP 濃度高于 20μM 以上時會極大抑制環(huán)化效率,甚至導(dǎo)致環(huán)化失敗。因此建議底物為純化產(chǎn)物。
(3) 由于本酶提高了耐熱性,在 65℃條件下進行連接反應(yīng),測試中 Betain 無益于連接效率提升。
(4) 本酶主要進行分子內(nèi)環(huán)化連接,分子間的連接未檢測到。
(5) 本酶對 ssDNA 和 RNA 的環(huán)化效率極高,多數(shù)情況下,90%以上的底物被環(huán)化。未被環(huán)化的 ssDNA 可通過加入 5U的 Exonuclease I,37°C 消化 15min 去除,以獲得高純度的環(huán)化 ssDNA。未環(huán)化的 ssRNA,將稍后給出去除方案。
(6) 本酶可以連接 15nt 以上的核苷酸,更長的產(chǎn)物連接參數(shù), 將稍后給出測試報告及 protocol。
(7) 對于連接底物量較少的實驗來講,推薦縮小體系,而不是減少酶的用量。在小體系實驗時注意體系的蒸發(fā),可加入礦物油以防止蒸發(fā)。