普通PCR與熒光定量PCR不同點比較
普通PCR又稱終點PCR,是最傳統(tǒng)與基礎(chǔ)的PCR方法,這種方法通過在產(chǎn)物正常擴增結(jié)束后,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺電泳等方式對產(chǎn)物染色、拍照,通過得到的條帶亮度對PCR產(chǎn)物的量、片段長度進(jìn)行分析。但是我們要注意很重要的一點,普通PCR不能反映反應(yīng)體系的起始狀態(tài),即樣品差異、擴增效率差異等多種情況都可能會導(dǎo)致最終的擴增效果,所以這種方法比較適用于疾病診斷與某些定性研究分析。
熒光定量PCR即qPCR、Real-time PCR,都是實時定量PCR。其原理就是在PCR反應(yīng)體系中加入特定的探針,其中含有熒光基團,熒光定量PCR儀在每一個擴增循環(huán)都會收集積累的熒光信號,從而達(dá)到對反應(yīng)體系的全程監(jiān)控與定量分析,所以qPCR既可以反映反應(yīng)體系的起始狀態(tài),也可以反映最終擴增效果,相比于普通PCR更精確,更簡單。
普通PCR與熒光定量PCR二者的實驗結(jié)果相同,都能說明生物體外的特殊DNA復(fù)制的整個過程的擴增效率和溶解溫度情況。但是二者的不同主要集中 在以下幾個方面:
1、二者原理不同
熒光定量PCR實時監(jiān)測與DNA結(jié)合的熒光染料激發(fā)的熒光,普通OCR通過檢測插入DNA中核算染料的量來測定PCR最終產(chǎn)物量。
2、二者系統(tǒng)組成不同
熒光定量PCR儀比普通的PCR儀多了熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng)。
3、二者反應(yīng)要求不同
熒光定量PCR對擴增片段有較高的要求,一般為100-300bp,普通PCR可以擴增長點的片段。
4、二者應(yīng)用不同
熒光定量PCR主要是用來定量分析和確定基因轉(zhuǎn)錄水平的,普通的PCR儀是做定性分析和擴增基因片段,定量PCR儀可以做普通PCR儀的工作,反之不行。
5、二者測量成本不同
定量PCR儀價格較為昂貴,普通的基因擴增儀(PCR儀)只能夠定性地分析是否存在目標(biāo)片段。但是價格要低很多,而且運行成本也要低很多。
實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。